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上海市公共卫生临床中心
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高速基因分析系统
型号:NovaSeq6000
制造厂商:
购置日期:
生产国别:美国
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仪器详情
用户评价
功能/应用范围:
应用于任何生物分子间的相互作用分析,获得数据包括亲和力、结合能量学(ΔG,ΔS,ΔH)、化学计量学、酶动力学、结合位点、直接测量或在竞争性试验中研究抑制物亲和力Ki等。 未知物种全基因组测序,已知物种再测序,全基因表达组定量分析,全基因组小RNA分析,染色质免疫互沉淀(ChIP)研究,甲基化研究,转录组分析;
主要技术指标:
1.温度:19&ordm;C-25&ordm;C(22&ordm;C±3&ordm;C),每小时变化<2&ordm;C;湿度:相对湿度20%-80% 2.电源要求:208–240 VAC 50/60Hz,16A; 3.高数据通量:单次反应可生成大于3000G碱基数据 4.每次运行可生成可读100亿个片段标签序列 5.快速读取:2天内带来高达6 Tb的产出和200亿(B)条reads 6.运行成本:从样品扩增到数据读取,每测量1G个碱基对所需成本低于35美元 7.测序精准度:可精确读取≥10个的连续单个重复碱基(如AAAAAAAAAA),准确性≥99%(50bp); 8.试剂溯源性和兼容性:带有RFID条码的耗材实现了自动的试剂追踪,确保了所有测序试剂和流动槽的兼容性; 9.自动化:自动化的流动槽上样和仪器集成的簇生成最大限度减少了手动操作时间以及手动操作的可变性,簇生成与测序自动化一体操作; 10.测序灵活性:每次运行1个或2个流动槽,并从多个读长中选择,从而轻松调整每个测序运行的产出 11. 测序数据质量:Q30≥ 85 %
服务内容:
服务典型成果:
用户须知:
对外服务时间:节假日以外。参数:(1) 采用平行测序原理,每轮实验至少产生12亿个片段标签序列,每轮次反应至少达到120G碱基数据,最多可达600G碱基及以上数据; (2) 数据读长:单端读取序列,读长不低于150个碱基;双端读取序列,读长不低于2x150个碱基; (3) 读取精度:原始数据准确性≥98%,3倍覆盖拼接序列准确性≥99%;可精确读取≥10个的连续单个重复碱基(如AAAAAAAAAA),准确性≥99%(50bp); (4) 不同样品并行性:仪器运行可平行分析≥16个非混合的独立样品; (5) 制备样品用量:DNA样本需要0.1-1ug;测序结果以碱基形式显示,方便数据的比对和分析; (6) 配备分析软件:可以分析基因组分析系统产生的数据;可以把不同类型数据整合到同一个项目中;算法可以支持的应用包括测序数据分析,基因表达、基因分型、小RNA、等一系列应用。附件:cBot Instrument样品制备系统
收费标准:
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