为合肥关区海关监管、征税、检验检疫、缉私职能的履行提供技术支撑，承担安徽省出入境产品实验室检验、检测、检疫、鉴定、研究咨询与风险分析；承担海关监管、征税、检验检疫、缉私等相关领域科研与技术开发、服务，提供技术咨询和技术培训等工作；开展海关技术规范等标准的制（修）订；开展对外技术合作与交流；承担政府部门、社会组织、企业及个人委托的实验室检验、检测、检疫、鉴定及其他业务等。